發表過700篇論文、擁有100多項專利的翁啟惠，是全球首位成功研發「一鍋式合成法」及以酵素技術合成大量複雜多醣物的科學家，對許多疾病新藥開發貢獻良多，2006年回台接任中研院長，卻在2016年因浩鼎案淪為貪污被告，失去院長一職，在捲入浩鼎案的903個日子中，他始終冷對外界指控與官司，然而就在接受《蘋果》專訪這天，他罕見地哽咽了，他失落的說：「我回台灣是想幫忙，只有付出，但是到最後卻變成我做錯了什麼，感覺不是回到自己的家……」，為什麼一心貢獻，卻落得這步田地，讓他沉痛無語。
翁啟惠是世界首位成功以酵素技術大量合成複雜多醣物的科學家，他發明的「一鍋式合成法」，也是第一個自動化合成多醣分子的方法，可快速合成醣分子，此2種方法已被產業界廣泛用於開發治療心臟病、中風及各種發炎疾病的新藥。
翁啟惠對於醣分子領域的研究貢獻，讓他在國際學術界享負盛名，2014年更獲得有諾貝爾獎前哨站之稱的的「沃爾夫化學獎」，然而就在各界看好他下一步將可以獲得諾貝爾獎之際，他卻捲入了浩鼎案，一夕間，從學術界的崇高地位墜落，淪為遭外界指責、質疑的貪污被告。
專訪這天，談起因浩鼎案被依貪污罪起訴，翁啟惠一開始仍平靜的說：「失望又傷心，怎麼台灣會這樣子，以為我拿中研院的東西給浩鼎。」
但陪著他受訪的妻子劉映理，談起2016年4月20日遭檢調登門搜索的那天，學藝術的她，沒辦法像翁啟惠一樣冷靜。
「那像是一個羞恥的烙印，很不堪，這個恥辱不知何時可以褪去，我從未想過我們的人生裡會和『貪污』二字搞在一起」。她說大清早5、6點，一大批調查官和辦案人員在家中四處搜索，讓她至今仍無法忘卻遭搜索、偵訊的噩夢，甚至看到被搜索過的家，就會勾起不好回憶，一度動了搬家念頭。
但翁啟惠卻是樂觀看待，「沒有那麼糟糕啦！」他認為，浩鼎案發生後，周遭朋友還是非常支持他，也讓他對朋友的是否真心，看得更清楚。而根據《蘋果》觀察，浩鼎案起訴後，每次法院開庭，旁聽席總有許多翁啟惠的親友，專程來為他聲援打氣，他的好人緣可見一斑。
提起引發浩鼎案風波的醣分子技術，翁啟惠解釋說，檢察官認定他私相授受給浩鼎，但其實這是源自他在美國時期的研究。他說，浩鼎的母公司Optimer是他跟浩鼎董事長張念慈所創辦的，當時醣分子技術就已經給了Optimer，因為創辦人都會被股東要求投資「表示你對技術有信心」，而他與妻子回國前就成立家庭信託基金，受益人是一對子女，因此當時他與妻子以信託基金去投資，目的就是要留給小孩。
但外界質疑他隱瞞女兒是浩鼎大股東，還將醣分子技術移轉給浩鼎，甚至在浩鼎乳癌新藥解盲失敗後，替浩鼎說話，是圖利、貪污、說謊。面對一連串的質疑，翁啟惠坦言，浩鼎案爆發的第一時間，他因在國外演講，又不清楚國內情況，延誤了回台時間，「如果再讓我選一次，我會早點回來」。他說，當時他曾和妻子考慮是否先行揭露持股狀況，但考量女兒安全，以及她已經是40歲的成年人，「我們沒有權利去揭露已經成年子女的財務隱私」，於是最後選擇不說，沒想到，風暴卻越來越大。
由於認為自己行得正、做得直，翁啟惠一開始對浩鼎案及檢調的偵辦動作並沒有特別感覺，他心想自己沒有問題，檢調要什麼給什麼就好，也認為已在偵訊時都說明清楚，沒想到最後卻被起訴，當下讓他難以承受。
直到法院開庭審理，很多事實才逐漸被釐清，翁啟惠說，原來檢調指控他將材料以4折賣給浩鼎，但一查原來是檢調人員將他學生的email中所寫的「4-folds」翻錯，把4倍翻成4折。
他說全案中像這種翻譯錯誤造成的誤解，不勝枚舉，原來是他的中文打字很糟，所以他平日對外的email全都是用英文，檢調人員調閱資料、電郵後必須再翻譯成中文，結果卻翻譯錯誤，最後指控他貪污。回想這些過程，翁啟惠啞然失笑：「不曉得要貪什麼！」
《蘋果》問他，「會不會後悔放棄美國的千萬年薪回到台灣？」翁啟惠沉吟許久後，悵然地說：「我回來台灣是想幫忙，過程中只有付出，絕對沒有拿什麼東西，但是到最後好像會變成我做錯了什麼，感覺上會覺得，你好像不是回到自己的家……」，語畢，他緊閉雙唇，用力克制早已在眼眶打轉的淚水流下。
事發雖已經過了2年多，但翁啟惠至今再看到當時遭檢調搜索、約談的畫面，仍感到狼狽、痛心，仍然就像是一根尚未拔掉的刺，讓他感到痛心疾首，永遠無法忘卻。
翁啟惠說，他回到台灣是想將台灣生技帶往國際，回國的這段時間，他促成《科技基本法》修法，鼓勵科學家發明、企業投資生技產業，搭起學術和實務間的橋梁，但經歷過浩鼎案後，他才知道我們的國家與社會對《科技基本法》根本不了解，依然將科學家看成一般的公務員，但實際上，中研院是學術研究單位，而《科技基本法》不受《公務員法》、《政府採購法》、《國有財產法》限制，因為只有在這種情況下，才能將政府的研究成果移轉到產業界，學術研究才有意義。
不過即便遭到搜索、約談、起訴，翁啟惠卻不責備檢調單位，認為只是誤解造成的結果，他甚至自我解嘲地說：「假如最後結果證明我是被冤枉，可能會讓我更受尊敬啊」，他甚至不改科學家的精神，認為他還是有收穫，「那時候調查官要我手機給他看一下Line，我反問什麼叫Line，我就拿出我的黑莓機給他，調查官就又說算了、算了，我從那天起開始學習用LINE。」
其實這次採訪讓《蘋果》驚訝的，不只是如此頂尖的科學家不知道LINE，而是至今發表超過700多篇論文的翁啟惠，早期有高達200、300篇論文都是用手寫，再交由秘書用打字機繕打，他說，自己雖然曾經硬著頭皮努力學中文打字，但還是不太習慣，因此他現在若遇到需要用中文寫信和人聯絡，都是用電腦的專業電子手寫板輸入。
過去美國知名新聞台ABC曾對翁啟惠提出專訪邀請，他原本以為對方是要報導關於他的重大研究成果，「結果細問才知道，他們只是要知道，我在服務單位是最多產、發表最多論文的學者，但是不使用電腦，怎麼能夠生存」，翁啟惠覺得不受尊重，於是婉拒採訪。
不會電腦打字，也不會用LINE，甚至不知道該如何從銀行臨櫃領錢，翁啟惠滿腹科學知識，但對於日常生活的技能卻所知甚少，一旁的劉映理笑著替他緩頰，翁啟惠是因為太忙了，所以才由她處理瑣事，「他對待金錢很阿莎力，從不記帳，這個事情(浩鼎案)就是這樣搞砸了」。
雖然遭檢調搜索、約談，甚至起訴，但翁啟惠仍然相信，司法最終會還以清白。他說，這是第一個關於生技技轉的司法案件，假如能夠透過審理，讓大眾及司法界了解何謂技轉，也是一種進步，未來他也會持續幫助年輕人進行研究，「我一路走來都遇到障礙，但是都有辦法克服，所以我是樂觀在看這個事件，繼續往前走」。（顏凡裴／台北報導）